工程结算审计质量控制的措施必须适应经济发展要求，不断改进，不断开拓创新，必须贯穿于工程结算审计业务工作的全过程，包括审计准备、审计实施、审计报告等各个环节。保证工程量计算准确的做法两批人算量——这种方式人力要求比较高，但速度快，结果也比较准确。
1、大数覆算：一般工程算量都由若干人分工协作，因此可以在完成算量后进行交叉检查，分别去核对对方算量中主要的工程量，如果差异较多，再进行详细核对。
2、指标检查：工程量之间都会有一定的逻辑关系，存在一定的指数范围，可以利用这些指数范围来核对计算结果是否有偏差，如果超出范围，需要进行仔细核对。
3、重算合同：对于图纸还不到位的项目，我们一般会建议甲方实行暂定工程量的方式，投标时以评比综合单价为主，中标后再重新计算工程量，签订Zui终的合同。这种方式适合于项目图纸不全，但有过类似项目，清单描述方面基本没有问题的工程。
五、提高工程量清单编制质量
实行工程量清单计价后对工程量清单的质量要求和工程量计算的准确性要求应该更高，因为工程量清单质量低劣、计算不准确，会给招、投标双方带来不必要的风险和纠纷。
1、熟悉《规范》内容，避免重、漏项
在工程量计算过程中，首先应做到不重项、漏项，因为重项、漏项会加大招标人的工程量风险,使工程造价难以控制。
2、准确进行特征描述
特征描述不清楚是目前工程量清单编制中比较典型的问题，应引起清单编制人员的重视，因为特征描述不清容易引起理解上的差异，造成投标企业报价时不必要的失误，影响招标的工作质量。特征描述不清楚除了投标企业报价不准外，还可能埋下争议和索赔的隐患。
3、掌握工程量清单的编制原则
工程量清单应当依据招标文件、施工设计图纸、施工现场条件、各种操作规范、标准和《规范》进行编制，编制过程应当遵循“四统一”原则。
4、正确计算工程量
工程量计算是工程量清单编制工作的主要内容，工程量计算的准确性直接影响到清单的质量，因此，清单编制人员应认真、细致计算工程量。
5、认真校核工程量清单
工程量清单编制完成后，除编制人要反复校核外，还必须有其他人审核。工程量清单校核的内容主要有：清单项目是否重项、漏项，项目特征描述是否清楚，工程量计算是否有误。
6、提高设计文件深度
图纸设计深度是影响工程量清单编制质量的一个重要原因。设计深度不够，会使项目设置不准确和特征描述不清楚，因此，要提高清单编制质量，还应从提高设计文件的质量方面入手，设计文件应能满足工程量清单计价的需要。
把好工程结算审计准备关，制定切实可行的审计实施方案。审计准备是对一个工程结算审计项目实施审计前所做的各项准备工作。准备工作是否充分，对工程结算审计实施能否顺利进行和保证工程结算审计质量，都有着重要的影响。把好工程结算审计准备关，需要重点抓好审前调查、审计方案编制环节。审前调查可以选择查阅资料、走访等多种方式，既要了解施工单位的性质、体制、规模等基本情况，又要收集与工程项目有关的法律、法规、规章和政策、会议记录等资料，还要了解工程项目有关的竣工图纸、工程变更联系单、承发包合同(承包方式、结算办法及施工期限等)、承包方提交的工程竣工决算书等。